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| 序号 | 类别 | 类别 | 名称 | 所属学院 | 负责人 |
| 1 | 国家级平台 | 国家级工程研究中心 | 工业过程自动化国家工程研究中心 | 光电学院 | 王亚刚 |
| 2 | 国家工程实验室 | 分子免疫诊断试剂国家工程实验室 | 版艺学院 | 蔡锦达 |
| 3 | 创新人才推进计划 | 创新人才培养示范基地 | 学校 | — |
| 4 | 教育部协同创新中心 | 上海太赫兹波谱与影像技术省部共建协同创新中心 | 光电学院 | 张大伟 |
| 5 | 地方高校新建学科创新引智基地（简称“111计划”） | 太赫兹精准生物医学技术学科创新引智基地 | 光电学院 | 朱亦鸣 |
| 6 | 国家基础科学中心 | 太赫兹科学技术前沿基础科学中心 | 光电学院 | 朱亦鸣 |
| 7 | 国家质量监督检验中心 | 国家光学仪器质量监督检验中心 | 光电学院 | 黄卫佳 |
| 8 | 省部级重点实验室 | 教育部重点实验室 | 医用光学技术与仪器教育部重点实验室 | 光电学院 | 张学典 |
| 9 | 上海市重点实验室 | 上海市现代光学系统重点实验室 | 光电学院 | 庄松林 |
| 10 | 上海市重点实验室 | 上海市动力工程多相流动与传热重点实验室 | 能动学院 | 张华 |
| 11 | 上海市国际联合实验室 | 太赫兹技术创新国际联合实验室 | 光电学院 | 朱亦鸣 |
| 12 | 民政部重点实验室 | 民政部神经功能信息与康复工程重点实验室 | 健康学院 | 喻洪流 |
| 13 | 国家资讯出版总署重点实验室 | 资讯出版总署数字传播科学重点实验室 | 版艺学院 | 蔡锦达 |
| 14 | 出版融合发展重点实验室 | 出版融合发展重点实验室 | 版艺学院 | 蔡锦达 |
| 15 | 出版业科技与标准重点实验室 | 可信数字版权生态与标准重点实验室 | 版艺学院 | 施勇勤 |
| 16 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业精密磨削技术重点实验室 | 机械学院 | 李郝林 |
| 17 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业环保制冷剂应用研究重点实验室 | 能动学院 | 张华 |
| 18 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业汽车底盘机械零部件强度与可靠性评价重点实验室 | 机械学院 | 郑松林 |
| 19 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业数控机床优化技术重点实验室 | 机械学院 | 丁晓红 |
| 20 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业精密光电测试技术与仪器重点实验室 | 光电学院 | 庄松林 |
| 21 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业煤（气）高效燃烧与超低排放重点实验室 | 环建学院 | 张道方 |
| 22 | 机械工业联合会重点实验室 | 机械工业厂房大空间健康环境与节能重点实验室 | 环建学院 | 王昕 |
| 23 | 教育部工程研究中心 | 现代微创医疗器械及技术教育部工程研究中心 | 健康学院 | 宋成利 |
| 24 | 教育部工程研究中心 | 光学仪器与系统教育部工程研究中心 | 光电学院 | 张大伟 |
| 25 | 资讯出版总署工程研究中心 | 资讯出版总署数字印刷工程研究中心 | 版艺学院 | 蔡锦达 |
| 26 | 上海工程研究中心 | 上海市极端光学制造与检测工程研究中心 | 光电学院 | 张大伟 |
| 27 | 上海工程技术研究中心 | 上海粉末冶金汽车材料工程研究技术中心 | 材化学院 | 薛裕华 |
| 28 | 上海工程技术研究中心 | 上海数控装备工程技术研究中心 | 机械学院 | 李郝林 |
| 29 | 上海工程技术研究中心 | 上海康复器械工程技术研究中心 | 健康学院 | 喻洪流 |
| 30 | 上海工程技术研究中心 | 上海食品微生物工程技术研究中心 | 健康学院 | 艾连中 |
| 31 | 上海工程技术研究中心 | 上海介入医疗器械工程技术研究中心 | 健康学院 | 程云章 |
| 32 | 上海工程技术研究中心 | 上海食品快速检测工程技术研究中心 | 健康学院 | 徐斐 |
| 33 | 上海工程技术研究中心 | 上海环境生物安全仪器及装备工程技术研究中心 | 光电学院 | 张大伟 |
| 34 | 上海工程技术研究中心 | 上海高性能医疗器械材料工程技术研究中心 | 材化学院 | 刘平 |
| 35 | 省部级平台 | 上海市专业技术服务平台 | 上海市生物物质成药性评价专业技术服务平台 | 理学院 | 张淑平 |
| 36 | 上海市专业技术服务平台 | 上海超精密光学加工与检测专业技术服务平台 | 光电学院 | 张大伟 |
| 37 | 上海市专业技术服务平台 | 上海市LED器件检测专业技术服务平台 | 光电学院 | 戴博 |
| 38 | 上海市专业技术服务平台 | 上海市生物资源低温保存专业技术服务平台 | 健康学院 | 刘宝林 |
| 39 | 上海市专业技术服务平台 | 上海市新能源汽车可靠性评价公共技术服务平台 | 机械学院 | 郑松林 |
| 40 | 上海市专业技术服务平台 | 水下工程检测专业技术服务平台 | 机械学院 | 朱大奇 |
| 41 | 上海市军民融合基地 | 超精密光学制造军民融合公共服务平台 | 光电学院 | 张大伟 |
| 42 | 上海市前沿科学研究基地 | 上海市类脑光子芯片前沿科学研究基地 | 光电学院 | 顾敏 |
| 43 | 上海市协同创新中心 | 太赫兹波谱与影像技术协同创新中心 | 光电学院 | 张大伟 |
| 44 | 上海市协同创新中心 | 上海市肿瘤能量治疗技术与器械协同创新中心 | 健康学院 | 刘宝林 |
| 45 | 上海市制造业创新中心 | 上海高端医疗装备创新中心 | 材化学院 | 刘平 |
| 46 | 国家粮食技术创新中心 | 国家粮食产业（城市粮油保障）技术创新中心 | 健康学院 | 管骁 |
| 47 | 交通运输部研发中心 | 卫生防疫技术交通运输行业研发中心 | 能动学院 | 张华 |
| 48 | 省部级文科基地 | 上海市人民政府决策咨询研究基地 | “基于互联网+的上海创新发展”决策咨询研究基地 | 管理学院 | 吴忠 |
| 49 | 教育部国别和区域研究中心 | 中国周边经济研究中心 | 管理学院 | 魏景赋 |
| 50 | “十四五”上海民政科研基地 | “十四五”上海民政科研基地（民政事业殡葬研究方向） | 管理学院 | 鲁虹 |
